dPUC

¡Extienda sus predicciones de Pfam sin perder precisión usando el contexto de dominios!

¡dPUC 1.0 está obsoleto!

Por favor siga el siguiente vínculo para ir a la página del proyecto de dPUC 2.

dPUC 2, Domain Prediction Using Context
¡Extienda sus predicciones de Pfam sin perder precisión usando el contexto de dominios!
github.com

La página del proyecto viejo seguirá disponible por razones históricas.

Búsqueda de predicciones

Busque entre nuestras predicciones de dominios en doce organismos (seis especies de Plasmodium [P. falciparum, P. vivax, P. knowlesi, P. chabaudi, P. berghei, P. yoelii], Homo sapiens, Drosophila melanogaster, Caenorhabditis elegans, Saccaromyces cerevisiae, Escherichia coli, y Mycobacterium tuberculosis.), y vealos gráficamente, organizados por ortología. Busque usando el identificador (ID) de proteina, nombres y accesiones de dominio (Pfam, SMART, y Superfamily), o palabras clave.

Baje predicciones

Obtenga nuestras predicciones de dominios y términos GO en texto sencillo en los doce organismos prueba de nuestra publicación.

Búsqueda en secuencias

Esta forma ejecuta nuestra búsqueda dPUC por dominios de Pfam en sus secuencias de preferencia.

Código fuente

Baje nuestro código fuente Perl, en un archivo tar compreso con gzip.

Cita

2011-03-31. Alejandro Ochoa, Manuel Llinás, Mona Singh. Using context to improve protein domain identification. BMC Bioinformatics. 12:90. PubMed. PubMed Central. Artículo.